Aspergillus spp. Isolated from Lungs of Poultry (Gallus gallus) at the Mycology Laboratory, School of Veterinary Medicine, Universidad Nacional, Heredia, Costa Rica between 2008 and 2021 and Associated Factors

Abstract

Aspergillosis is a disease caused by some species of the fungus Aspergillus, occurring in both mammals (including humans) and birds, the latter being the most susceptible group. Aspergillus must be considered a public health concern as it affects the poultry industry economically and is an occupational risk to its workers. A retrospective study of fungal isolates from the lungs of chickens (Gallus gallus), analyzed between 2008 and 2021 at the Mycology Laboratory, School of Veterinary Medicine, Universidad Nacional, Heredia, Costa Rica was performed to report the prevalence of Aspergillus spp. in poultry farms in Costa Rica and their associated factors. A total of 1113 cases were received, of which 31% (n = 392; 95% CI: 28.3–33.7) were positive for fungal isolation. Aspergillus was the most frequently detected genus, and the most frequent sections were Fumigati (n = 197/392, 50.3%), Flavi (n = 90/392, 22.9%), and Nigri (n = 50/392, 12.7%). Significant effects (p < 0.05) related to the year, geographical origin, purpose, and age were identified in relation to the Aspergillus infection. The identified factors are explained by climatic variations in the tropics and the particularities of the birds. Future research including molecular characterization and antifungal susceptibility tests in animals, humans, and the environment, are needed to better understand the risks of the diseases caused by those fungi in this country.

La aspergilosis es una enfermedad causada por algunas especies del hongo Aspergillus, que se presenta tanto en mamíferos (incluidos los humanos) como en aves, siendo estas últimas el grupo más susceptible. Aspergillus debe considerarse un problema de salud pública, ya que afecta económicamente a la industria avícola y supone un riesgo laboral para sus trabajadores. Se realizó un estudio retrospectivo de aislamientos fúngicos de pulmones de pollos (Gallus gallus), analizados entre 2008 y 2021 en el Laboratorio de Micología, Escuela de Medicina Veterinaria, Universidad Nacional, Heredia, Costa Rica, para reportar la prevalencia de Aspergillus spp. en granjas avícolas de Costa Rica y sus factores asociados. Se recibieron 1113 casos, de los cuales el 31% (n = 392; IC 95%: 28,3-33,7) fueron positivos al aislamiento fúngico. Aspergillus fue el género más frecuentemente detectado, y las secciones más frecuentes fueron Fumigati (n = 197/392, 50,3%), Flavi (n = 90/392, 22,9%) y Nigri (n = 50/392, 12,7%). Se identificaron efectos significativos (p < 0,05) relacionados con el año, el origen geográfico, la finalidad y la edad en relación con la infección por Aspergillus. Los factores identificados se explican por las variaciones climáticas en los trópicos y las particularidades de las aves. Futuras investigaciones, incluyendo caracterización molecular y pruebas de susceptibilidad antifúngica en animales, humanos y medio ambiente, son necesarias para entender mejor los riesgos de las enfermedades causadas por esos hongos en este país.